이온교환수지에는 미반응 고분자물질등 극미량의 불순물이 있으며 특히 아민기를 가지고 있는 음이온교환수지는 약간의 냄새가 나기도 한다. 이런 때에는 냄새나 맛, 유기물질유출을 예방하기 위해 Conditioning을 실시한다.

일반적으로는 통액전에 해당재생제로 재생작업을 하는것으로 충분하지만 좀더 "정밀한" 용도에는 4∼8% HCl과 4% NaOH용액으로 교차 세척 후 120분간 SV 5로 수세한 다음 수온 70˚C의 열수로 120분간 SV 5로 온수수세를 한 후 배량 재생작업에 들어간다